Empresa baixada emitiu nf após a baixa

Pessoal estou com um problema, temos uma empresa Simples Nacional que foi baixada na Junta em 20/12/2012, mas por falta de comunicação aqui no escritório após essa data foram emitidas notas fiscais de venda, talão de consumidor, gerando inclusive a DAS de 01/2013, não entregamos a declaração de extinção em janeiro por ter movimento após a data da baixa, e pensamos em entregar como se a data da baixa fosse 20/02/13, após pagamento da DAS,que seria o último lançamento para encerrar o balanço e entregar a declaração, mesmo pagando a multa, mas quando fomos entregar a mesma, apareceu que desde a data da baixa a empresa foi desenquadrada do Simples Nacional, então não sabemos como vamos fazer para entregar a declaração agora.
Poderíamos retificar a DEFIS entregue agora em março do calendário de 2012 e selecionar situação especial e colocar extinção, mesmo tendo emitido notas em 01/2013?
O estranho é ter gerado a DAS sendo que a empresa estava desenquadrada, se alguém souber o que pode ser feito nesse caso ou se já passou por algo parecido, nos ajudem por favor.
Grata.

Boa noite!
Patricia, é que esta muito confuso a sua explicação.
Como se deu o seu desenquadramento? Qual foi a mensagem?
Exclusão por oficio?

Bom dia Ricardo.

Então a mensagem que apareceu quando fui entregar a DEFIS de extinção agora em 2013 foi a seguinte:
"Excluida por Ato Administrativo praticado pela Receita Federal do Brasil"
A data é a data da baixa na junta: 21/12/2012.

Obrigada!