Boa tarde Almeida,
Com relação às taxas de alvará e vigilância sanitária, vai depender de cada prefeitura, sugiro que você busque esta informação junto à prefeitura. Para uma lanchonete, além de ela estar registra na Junta do Comércio do Estado, SRF, Prefeitura, e no próprio estado (Inscrição estadual para fins de tributação de ICMS) não há outras exigências a serem observadas para constituição.
Está é minha opinião, salvo melhor juízo.
Vasconcelos Reis Wakim
Contador CRCMG 082870/O-8 T-TO
Mestrando em Desenvolvimento
Regional e Agronegócio - UFT/TO