Então,
Toda empresa precisa ter sua licença de funcionamento.
O prédio possui pois é uma empresa de locação de salas comerciais (por exemplo). Esta licença é válida apenas para a administradora do prédio.
Cada empresa lá estabelecida deve emitir sua própria licença junto à prefeitura (lembrando que a licença permite que você exerça sua ATIVIDADE e cada empresa tem uma atividade distinta).
Em geral, empresas que se alojam em prédios são de atividades de BAIXO RISCO. Com isso a licença pode ser emitida de modo eletrônico que em geral fica pronto no mesmo dia. Não faça protocolo físico, pois vão solicitar plantas, art de engenheiro, habite-se, etc, além de demorar meses (ou anos) para ficar pronto.
Se tiver dúvidas se a atividade da empresa é de baixo risco ou como fazer a solicitação da licença, pode entrar em contato comigo. Meus dados estão abaixo.
Abraços.