Baixa de empresa que esta com serviço inativo mas que possue

Colegas,

Tenho uma empresa de prestação de serviços situada na cidade de SP. Essa empresa deixou de funcionar a muito tempo e o proprietario apenas fechou as portas, sem encerrá-la burocraticamente.
Para encerrá-la, vi que ela possui dividas: Prefeitura de Sao Paulo, Ausencia de Declarações DCTF Receita Federal, Debito em cobrança na SIEF da Receita Federal, Divida Ativa na PGFN.

Minha dúvida é, consigo encerrar essa empresa e apos atraves do CPF do Proprietario procurar o parcelamento dessa divida (de todos esses orgãos)? Ou o ideal é pedir o parcelamento em todos esses orgãos e fazer a baixa em seguida, para constar como CNPJ suspenso sem que a divida aumente?