Como registrar um mini-mercado com padaria e açougue que desenvolve seu sistema de automação (NFC-e/

Olá Contábeis,

Gostaria de saber os detalhes do registro de empresa que além de ser um mini-mercado com padaria e açouque, seu proprietário desenvolveu seu próprio sistema de automação comercial (para emissão de NFC-e, SAT, NF-e) e precisa homologar seu sistema junto a receita usando o CNPJ do mercado onde ele desenvolve o sistema? Detalhe, será MEI.

Agradeço!