Bom dia Mariza Nascimento!
Aqui em MG, a Junta Comercial também adota este procedimento, ou seja, empresas sem efetuar nenhum registro na Jucemg nos últimos 10 anos terá o seu registro cancelado.
Caso a empresa realmente estiver inativa e desejar "baixá-la", basta emitir uma Certidão Simplificada e fazer o pedido de Baixa nos demais órgãos (RFB, Estado, Município, etc.).
Agora, se a empresa ainda esta em plena movimentação, deverá fazer o registro na Junta Comercial da reativação da mesma, onde a empresa irá recolher as mesmas taxas e terá os mesmos procedimentos de uma alteração de dados.
Nesta oportunidade, a empresa poderá atualizar seus dados na Junta Comercial, como por exemplo, acrescentar o n° so CNPJ, atualizar e-mail e telefone, dentre outros.
Agora, imagino eu que aí no RJ seja o mesmo procedimento.