A Receita Federal pode alterar o QSA sem que haja alteração contratual?

Bom Dia!, estou precisando de ajuda. Uma empresa extinta por encerramento liquidação voluntária, mas que ainda possui pendências de DCTF e omissão de GFIP.Ao verificar o Quadro de Sócios e Administradores no site da Receita Federal, na seção "Consultar Pendências e Situação Fiscal", percebi que as quotas dos sócios foram alteradas, sem que tenha sido feita alteração contratual.Antes dessa alteração feita pela Receita Federal, a composição societária era a seguinte:·      
João: 99% das quotas, sócio administrador·       
Maria: 1% das quotas, não administradora
Contudo, após o encerramento da empresa, constatei que a Receita alterou a distribuição para:

50% para João e
50% para Maria, constando ainda que ambos são administradores.
Mas o que quero frisar é que não houve alteração contratual registrada que justificasse essa mudança nas quotas e na administração.

Eles podem alterar isto? Sou contadora, mas é a primeira vez que me deparo com essa situação.
Alguém pode me dar uma ajudinha?

A maneira mais simples de sanar isso, caso já tenha pesquisado a existência de alteração contratual não feita por você na junta comercial do Estado, é via chat do e-CAC.