Sidnei,
Pode sim ser enviada alteração contratual juntamente com o DBE para deferimento pela JUCERJA.
O convênio disciplina que os atos de abertura e alteração podem ser realizados pela JUCERJA.
Acesse o Site da JUCERJA para conferir.
https://www.jucerja.rj.gov.br
Vá em serviços mais acessados, e lá, tem a opção CNPJ.
Vc verificará o texto que copio abaixo:
Orientações para utilização do Convênio CNPJ
Por meio de convênio firmado com a Receita Federal, a Junta Comercial do Estado do Rio de Janeiro (Jucerja) está habilitada a deferir inscrições e alterações no Cadastro Nacional da Pessoa Jurídica (CNPJ) juntamente com o registro da documentação da empresa. A parceria é mais uma iniciativa da Jucerja visando a facilitar e simplificar o processo de abertura e alteração de empresas.
Espero ter ajudado, inté