Marcelo, não há de que se desculpar, estamos aqui para nos ajudar ... Vamos lá, Você precisará sim de registro na Junta, CNPJ e todos os outros documentos legais, isto se deseja manter seu negócio de maneira legal e 'saudavel'.
Primeiro passo é procurar um contador de confiança em sua cidade, para que providencie o necessário, registro na junta comercial, abertura cnpj, o e-commerce não há necessidade de nada especifico além de um desenvolvedor de web sites é claro.
ATENÇÃO -> Quanto a estoque, tudo bem utilizar a casa porém deve ser em local que seja adequado e que atenda aos quesitos legais estipulados pela VIGILÂNCIA SANITARIA, que ira fazer a vistoria em seu imovel. Acredito ser a parte mais dificil para seu negocio.
Acredito ser dificil te precisar qualquer coisa quanto a isto, aconselho que procure um contador de sua cidade, pois cada municipio tem suas politicas adotadas, alguns mais flexiveis outros nem tanto.
Espero ter ajudado, caso queira saber mais sobre impostos e relativos fique a vontade, todos do forum terão prazer em ajuda-lo.
Atenciosamente,
Leonardo Mz.