Boa noite Ingrid
Acredito que ambas são importantes, tanto você ter a procuração de seus clientes (para consultas por exemplo no portal e-CAC e para Conectividade ICP), como também eles possuírem seus próprios certificados, por exemplo, você usou o exemplo de Notas Fiscais, se você estiver se referindo a notas fiscais eletrônicas cada cliente precisará ter seu próprio certificado para transmiti-las, mesmo que desse certo com procuração, já imaginou a situação de cada cliente solicitar o certificado quando for emitir uma nota?
Em resumo, acredito que seria interessante fazer as duas coisas de que você falou, tanto a procuração quanto a emissão de certificado próprio (Lembrando que a procuração para conectividade ICP só é possível quando o Outorgante já possui o Certificado Digital).
Espero ter contribuído e uma ótima semana!
"Bem-aventurado o homem que acha sabedoria, e o homem que adquire conhecimento;"
Provérbios 3:13
Tecnólogo em Gestão Financeira
Pós-Graduado em Direito Tributário em Contabilidade
Atividades: Consultoria Financeira, de Custos e Gestão Fiscal/Tributária