Camila Mayer,
O documento fiscal válido é o XML, porém mesmo com a instituição da nota fiscal eletrônica, os documentos físicos ainda são solicitados em fiscalizações. A guarda do XML obedece aos mesmos 5 anos da guarda dos antigos documentos físicos.
Se seu cliente não está enviando as notas impressas não há problemas, mas a guarda destes documentos está sob a sua responsabilidade? Caso esteja, converse com seus clientes e lhes informe a necessidade de enviar os documentos impressos.
Se não houver acordo quanto a esta questão, há a possibilidade de que você mesma faça a impressão através de sites específicos e depois , se for o caso, cobre as impressões que forem necessárias do cliente junto à sua mensalidade (informar o procedimento antes de colocar em vigência). Essa cobrança pode motivá-lo a enviar os documentos.