Boa tarde Carlos, aconteceu isso comigo também, fiz uma comunicação manual dia 09/04 com data do acordo em 04/04, e também não conseguia visualizar as informações da comunicação depois do envio, sempre dava nenhum benefício emergencial encontrado. Quando foi depois do dia 20/04, consegui um contato do Mte direto do benefício emergêncial, e eles me informaram que era falha do sistema, que eu teria que enviar novamente e comunicação, eu estava preocupado com o prazo dos 10 dias para comunicar que já tinha passado, mas na época, ela informou que eu tinha um prazo para comunicação de 10 dias após a publicação da portaria 10.486 que é a que dispõe sobre o benefício. A portaria foi publicada em 24/04, então eu tive um prazo até 03/05.
No seu caso, imagino que vá ter que comunicar novamente, apenas se quando você consulta aparece: "Nenhum benefício emergencial encontrado." Mas por via das dúvidas, a secretaria regional do trabalho da sua cidade deve ter algum número que eles disponibilizam para tirar essa dúvida.