Ana Paula,
Para baixar um Ativo do balanço, tem que ser através de Nota Fiscal ... Correto?
Imagino que você terá que emitir ao menos uma NF de de sucata desta mercadoria.
Quanto ao ICMS... Você terá que ver quando foi iniciado o crédito do ICMS via CIAP e entrada do Ativo em sua empresa... Geralmente é utilizado 20% do ICMS por ano (depreciação em 5 anos)... Sendo assim, imaginando que o ativo tenha 2 anos de uso, 40% do valor correspondente ao ICMS é direito de sua empresa, e caso o crédito já contabilizado supere esta porcentagem, o mesmo deve ser estornado...