em cima do que declarar o imposto da empresa

boa tarde pessoal como sou novo na aréa gostaria de fazer uma pergunta,tenho algums clientes novos porem alguns tem maquinas de cartoes e os deles faço o imposto em cima do valor das maquininhas de cartoes e gero os impostos mais como eles devem emitir essa nota fiscal tanto via eletronica quanto via talão porque eles tem emitir pelo menos uma nota no mês,sera que els podem emitir essa nota para eles mesmo tentei fazer isso em uma nota fiscal de serviços para um cliente mais o sistema da prefeitura nao deixou ele emitir essa nota para o cpf do titular da empresa.