Emissão de notas fiscais de serviço e peças em manutenção de

Oficina mecânica Optante do S.N. ao prestar serviço de manutenção em veículo para órgão público emite duas notas fiscais, NFS-e para os serviços e uma NF-e para as peças trocadas. Não há destaque do ICMS na NF-e e o CFOP é o 5405.

Perguntas:
- está correta a emissão de duas notas fiscais?
- nesse caso não haveria o cálculo do ICMS na NF-e?
- a oficina não deveria emitir apenas a NFS-e dos serviços, cobrando o valor dos serviços juntamente com o valor das peças, mas utilizando apenas o valor dos serviços para base de cálculo do ISS?

Agradeço a ajuda dos colegas, desde já.

Entendo que o jeito que está sendo feito está correto, ele cobra as peças, nota fiscal de venda das peças, OK. Ele cobra o serviço, nota fiscal de serviço.
Se os itens são sempre da substituição tributária então o cfop é 5.405, não tem que mencionar ICMS, pois já foi recolhido.
Juntar peça com serviço em uma única nota ficará errado.

Acredito que precisam ser observados alguns detalhes..
A empresa tem atividade para revenda de peças ou somente as usa para prestação do serviço?
As notas de compra dessas peças é emitida para a oficina ou diretamente para o cliente?

Olá Camila,
Boa tarde.
Agradeço sua postagem em atenção ao meu questionamento. Completando, a atividade econômica dessa empresa é de comércio e prestação de serviços de manutenção mecânica. Quero crer que se a empresa está emitindo nf para os serviços e nf para as peças empregadas, deva ter registrado as entradas dessas peças como "aquisição para revenda", caso contrário deveriam ser consideradas "custo" dos serviços realizados (material empregado na manutenção), e nesse caso, haveria somente a emissão da nf de serviços. O que vc pensa a esse respeito?