Repasse de despesa de transportadora

Olá, estou com a seguinte dúvida, uma transportadora emite CT, no entanto ao chegar no destino ela tem um gasto para descarregar a mercadoria com terceiros, para ressarcir esta despesa com o seu cliente é correto ela emitir um novo CT?

Este CT será tributado?

Não tem uma forma da transportadora somente fazer um recibo para não ser tributada novamente?

Obrigada