Emissão de Nota Fiscal - Benefícios e Despesas Indiretas

Bom dia!

Preciso emitir uma nota fiscal de serviços para o município referente a serviços da construção civil, porém tem 27,72% de BDI (benefícios e despesas indiretas).
Nunca tirei notas assim então não sei se posso incluir esse valor na emissão e como fica a questão das retenções:

Exemplo: Nota Fiscal total de R$ 15.866,97;
Mão de Obra: R$ 12.423,25
BDI: R$ 3.443,72
Retenção de INSS? Sobre o total ou sobre a mão de obra?
Retenção de ISS?

Agradeço se alguém puder me ajudar.

Cara Janaina, em relação ao ISS em via de regra o Município permite excluir o material, mas deve analisar a legislação Municipal se há outra regra de dedução do material.

Bom dia Raphael!
Agradeço seu esclarecimento.

Quanto aos materiais não tenho duvida pois estes vieram em separado para emissão.
Minha duvida é quanto ao BDI (benefícios e despesas indiretas)...
Pelo que entendo, o BDI é o rateio dos custos das obras não discriminados no preço. A empresa firmou um contrato num valor X com o município, porém acrescentaram um percentual referente ao BDI na medição para emissão das notas. Não estou compreendendo se devo ou não emitir a nota com esse valor de R$ 3.443,72... e se devo reter os impostos ou não sobre esse valor...

Cara Janaina, o BDI significa Benefícios e Despesas Indiretas, que consiste em um elemento que compõe um orçamento, normalmente alcançado através de taxas que incidem sobre o custo do empreendimento definindo o custo total, logo, conforme o art. 7º da Lei Complementar 116/2003, a base de cálculo do imposto é o preço do serviço, logo, tudo que é acrescentado para a cobrança, deve ser emitido uma NF de prestação de serviço e tributada pelo ISS.