Conversão de notas papel para eletronica

Boa tarde!

Estamos solicitando baixa de uma empresa na prefeitura de São Paulo, essa empresa estava autorizada/obrigada a emissão de nota eletronica na prefeitura de São Paulo, mas continuou usando a nota papel, a baixa foi indefererida e foi solicitado converter as notas em papel em eletronica, estive pesquisando e a nota em papel pode ser usada como RPS, então converto o RPS (a nota papel) em eletronica, mas como faço isso se apenas emitir a nota e informar no corpo que é em substituição ao RPS, como ficam as datas os DAS, o sistema não emite com data retroativa, tenho nota desde 2011? Nossa estou perdida se alguem conseguir me ajudar agradeço.

obrigado!