Devolução de mercadoria e nova venda - duvida com o valor do

Bom dia a todos.

Tenho um cliente que fez uma nota fiscal de venda para uma construtora no valor de R$ 5000,00.
Parte dos produtos foram devolvidos pela construtora ao meu cliente, cerca de R$ 2000,00.
Após isso, meu cliente fez uma nova nota de venda no valor de R$ 4000,00 com os produtos corretos e mais alguns que a construtora solicitou.

Pois bem, é correto eu gerar nessa última nota um boleto de cobrança de somente R$ 2000,00 que seria a diferença da devolução e da última venda, já que na devolução da mercadoria não teve valores devolvidos ao cliente e somente deixado marcado como crédito na empresa.

Faço essa pergunta pois minha cliente quer fazer a nota fiscal com o desconto da devolução, gerando assim somente uma nota fiscal de R$ 2000,00 na última venda.

Não sei se consegui expressar bem a ideia do problema, mesmo assim obrigado desde já pela ajuda.