Boa tarde Daniele!
Se a empresa se encontra na SEFAZ como NÃO HABILITADO existe um motivo, certo?
Por exemplo: não está entregando obrigações acessórias ou não está recolhendo o ICMS, Houve simulação de existência de estabelecimento, O estabelecimento não foi Localizado, Não comunicou a sua mudança de endereço, Entre outras situações...
Emitir Nf-e para quem está com a I.E Suspensa ou Não Habilitada fica com o status de DENEGADA, ou seja, não validada perante a SEFAZ. Aconselho a proceder a compra como pessoa física, pois colocar na I.E. que é ISENTA está ERRADO, informar como EMPRESA NÃO CONTRIBUINTE também está ERRADO.
O correto é proceder com a regularização da I.E e reativá-la ou solicitar o pedido de Baixa.
Boa Sorte!