Escrituração - Notas Fiscais em atraso

Boa tarde, contadores

Realizo a escrituração de um posto de combustível, no mês 03/2016 a empresa acabou não enviando os documentos fiscais de entrada, com isso transmiti GIA e os SPED's em branco. Agora essas notas chegaram, são cerca de 40 notas que totalizam mais ou menos R$ 500.000,00. Gostaria de saber qual posição tomar em relação a isso.
Em todos os outros meses a empresa teve escrituração dessas notas.

Obrigado pela atenção,
Abraço a todos!

Escriture as notas e refaça todas as declarações (retificadoras) e a GIA irá gerar uma multa por ser substitutiva. Manda essa multa pra empresa e um termo de ciência de que eles não mandaram as notas no prazo.

Stephanie Carvalho, muito obrigado! Farei isso mesmo, e deixar meu cliente ciente de suas responsabilidades