Bom dia, Renata Morais de Oliveira !
À época da manutenção ocorrida, entendo eu que uma máquina ou equipamento ou bem foi remetido/deixado pela pessoa física para conserto, deveria ter sido emitida NF de entrada deste bem, a fim de acobertar a operação. Nota: a sua empresa emitiria a NF de entrada, haja visto a impossibilidade de emissão por parte do remetente, pessoa física, sem destaque de imposto e com CFOP 5/6.949 .
Dessa forma, você teria uma entrada que viria a balizar a emissão da NF de saída do bem e da peça sobressalente defeituosa que fora substituída, com CFOP 1/2.949, também sem destaque do imposto. Mas como suas operações, conforme seu relato, não foram acobertadas com documento fiscal (tanto a entrada do bem quanto a venda da peça de substituição, pelo que entendi), a emissão da NF de saída para remeter essa peça velha fica em dificuldade.
As questões acima estão respaldadas pela Portaria CAT nº 92/2001 e com aplicabilidade prática conforme resposta à Consulta Tributária nº 9.128, de 07 de julho de 2016.
Espero ter ajudado!
Atenciosamente,
Juber Roberto
CRC-GO 024.526/O-7