Transferência de Mercadoria entre estados (frete)

Boa tarde colegas!

Estou com a seguinte situação, e me gera dúvidas sobre qual o procedimento correto.

Uma transportadora, com matriz em SP e Filial em MG, quer emitir um CT-e retirando a mercadoria do armazém da Loja cliente lá em MG, e trazer para o armazém de SP. Entendo que nessa operação não existe a incidência do ICMS, pois se trata de um frete entre a filial e a matriz, estou correto?

Como se dá então a emissão do documento? ele deve emitir um CT-e ou NF-e? Estou meio perdido rs

Obrigado a quem puder ajudar.
PS: Empresa não optante pelo simples.

Everton,

Haverá sim incidência de ICMS neste caso. Emitirá uma nota fiscal para a transferência das mercadorias e um CTE para o transporte dos mesmos.

Lucas, obrigado pela resposta!

Então, o problema é que se trata de uma transportadora. Ele tem uma filial aí em BH, e quer que a transportadora filial traga a mercadoria pra matriz, em SP, pra daqui ele emitir o CT-e e entregar de fato ao destinatário.

Mesmo assim, vai haver a incidência do imposto normalmente?
E poderia me dar uma luz, de como eu faria essa emissão do CT-e? Ele nunca fez, e eu também fiz pouquíssimas vezes, nem lembro mais.

Obrigado mais uma vez :)

Everton,

Veja se estou correto, a transportadora em BH quer trazer a mercadoria para SP e de SP entregar para o cliente?

Isso! É a mesma transportadora. Ele quer que a filial lá pegue a mercadoria e traga pra cá, pra matriz em SP.