Boa noite Elisandra.
existe duas situações, quando vc trabalha com produtos substituidos, no momento da venda ao seu cliente vc agrega o ICMS e encerra a fase de tributação, a outra é quando vc compra qualquer mercadoria interestadual que está relacionada entre os produtos substituidos no seu estado, ai vc deve antecipar o imposto na compra e encerrar a fase de tributação dele.
é preciso observar se vc se encaixa nas duas situações ou em uma das duas.
vc deve primeiro observar a sua legislação e verificar qual artigo trás as mercadorias substituídas, lá encontrará qual o MVA-(Margem do Valor Agregado) de cada uma delas para aplicar no seu cálculo.
Edson Amaral