Emissão de Nota Carioca - valores que não são base de cálcul

Prezados colegas,
bom dia!

A empresa irá prestar serviço há um evento, que será reembolsado pelo Sebrae, e a exigência é que seja emitida a nf (Nota Carioca - RJ) no valor gastos com o evento e anexado todos os comprovantes de pagamentos.
Pergunto:

Ao emitir a nf, a empresa irá informar o valor total, e no campo “ Deduções”, irá informar o total que foi gastos com o evento conforme os comprovantes pagos e a diferença será a receita da empresa.
Haverá algum problema neste procedimento?

Desde já agradeço atenção e fico no guardo.

Atenciosamente,
Hugo Leonardo
Depto Fiscal