Como emitir CTe complementar de ICMS

Estou em duvida referente ao CTe complementar de ICMS, foi emitido Cte com alíquota menor.
No caso cte vai sair apenas com valores de ICMS ou vai ter mais base de calculo e alíquota?

Apenas valor do ICMS mais nada e em campo próprio. O seu sistema deverá estar configurado para isso, pois não há item, é item criado para este fim específico, nem mesmo gerará debito ao cliente! O pessoal de TI que configura deverá te ajudar com certeza.