Alvará Prefeitura de São Paulo

Boa tarde!
Já entrei no site da Prefeitura de São Paulo, li as orientações e a dúvida permanece.
Uma empresa com sede no Estado do RJ abriu uma filial em SP.
O processo da Junta já foi concluído.
Como faço para emitir o alvará? Há necessidade de comparecimento ou consigo resolver tudo pela internet?
Ao seguir o passo-a-passo, fiz o CCM - Cadastro de Contribuintes Mobiliários. Entretanto, entendi que uma senha seria liberada para acesso pela internet, entretanto, o formulário solicita o comparecimento no órgão local. Não entendi..
Há outra maneira de solicitar?

Maísa, boa tarde !
Temos filiais em SP, e quando ocorre problemas para a emissão do documento, temos que procurar qual é a subprefeitura que a empresa está cadastrada, geralmente é da região que ela se localiza ! Mas adianto que é muito complicado essa questão, pela burocracia !!!

Boa tarde Daniel,
Muito complexo!
Obrigada pela dica.