Empresa transportadora descredenciada.

Olá, Estou com duvida em relação ao sistema de escrituração federal (SEF II), uma transportadora está descredenciada para recolhimento do ICMS, ela faz o recolhimento antecipado por meio de GNRE ou DAE, as notas são emitidas sem o destaque do ICMS, justamente por ser pago antecipadamente, como devo informa no SEF II, com ou sem o destaque do ICMS na nota.