Aparecida,
A gráfica tem sua parcela de responsabilidade nisso, no meu entender a maior parcela até.
O que deve ser feito é parar de emitir no talonário duplicado e fazer uma comunicação à Secretaria da Fazenda do fato ocorrido.
Primeiramente te aconselho entrar em contato com alguém responsável pela gráfica urgentemente e pedir soluções que cabem a eles, pois quando vão confeccionar novos formulários não podem fazê-lo sem checar a última AIDF (Autorização de Impressão de Documentos Fiscais) que trazem o controle de numeração.
Se não te derem solução corra atrás disso porque é tido como situação grave.
@Oculto