MANIFESTAÇÃO DO DESTINATARIO

Bom dia Srs, (as)

Em relação a manifestação do destinatário, no que refere-se a "Desconhecimento da Operação" após manifestado tal Evento ainda é possível gerar um CT-e ou não?

A manifestação do destinatário é do destinatário da NF-e (é o destinatário indicado na NF-e que se manifesta), portanto, a transportadora não tem nenhuma relação com essa manifestação!
No mais, não podemos esquecer que o destinatário da NF-e pode se manifestar 3 (três) vezes, ou seja, hoje pode estar "desconhecimento da operação", amanhã pode estar "operação não realizada" e depois de amanhã pode estar "confirmação da operação".

Obs. O perigo para a transportadora é que no desconhecimento da operação a transportadora poderá ser autuada (por exemplo, a operação ser desconsiderada, a NF-e ser considerada inidônea) pois sabemos que os Fiscos responsabilizam as transportadoras nas autuações (não especificamente por "desconhecimento da operação", mas por infração indicada na legislação).
Agora, o fato do destinatário se manifestar pelo "desconhecimento da operação" não significa dizer que o CT-e estar impedido de ser autorizado!