Icms para estado errado

Boa tarde, preciso de uma ajuda! 
O ICMS de uma transportadora foi lançado errado para o estado destino e não de onde inciou o transporte. A empresa foi autuada, qual seria a solução para que a empresa não tivesse que pagar tudo novamente? Tenho como fazer esse reajuste? 

Para o Estado de origem já está resolvido pois foi lançado o crédito tributário via auto de infração.
Quanto ao Estado de destino, caso você peça a restituição do ICMS, ele terá que devolver o dinheiro recebido (já que foi pagamento indevido).

Obrigada. O Alim já foi feito, porém pedem que o cliente pague novamente, quero saber se existe uma outra solução para que o cliente não precise pagar com juros e multa e só depois pedir a restituição.

Explique melhor, então.
O Estado onde iniciou o transporte lavrou o auto de infração e quer que você pague também o ICMS transporte?
Você está afirmando que: QUEREM QUE PAGUE NOVAMENTE!
Quem quer que você pague novamente (qual Estado?).
Qual foi o Estado que autuou? Qual o relato do auto de infração? quais foram os dispositivos infringidos?