Amanda, bom dia!
Sim, tenho um cliente que estava na mesma situação aparentemente estava tudo ok, porém não estava conseguindo emitir nota fiscal pois a inscrição estadual estava barrada, entrei em contato com SEFAZ pediram para entrar no DEC, e realmente lá constava um comunicado de monitoramento do CNPJ, no mesmo explica o motivo do barramento da inscrição estadual e as providencias a serem tomadas para regularizar essa situação.
Então te oriento dar olhada no DEC, você consegue entrar com certificado digital da empresa, caso não tenha em mãos, solicite para seu cliente entrar com certificado e fazer uma procuração eletrônica para seu escritório, dessa forma dar para você acompanhar as mensagens vinculadas ao CNPJ no âmbito estadual.
segue link do DEC https://www.dec.fazenda.sp.gov.br/DEC/UCLogin/login.aspx
Espero ter ajudado.