Empresa de compostagem

Boa tarde colegas.

Gostaria que me ajudassem com uma questão de um cliente por favor. Cliente (empresa de compostagem) coleta resíduos orgânicos de uma determinada empresa, para acompanhar esses resíduos a empresa que esta enviando os resíduos emite um MTR, meu cliente recebe e aceita essa matéria orgânica na usina de compostagem dele, e cobra um valor X por tonelada recebida. Nesse caso, o meu cliente precisa emitir uma nota fiscal de entrada?