Dúvidas sobre Notas Fiscais de Devolução

Recebemos umas mercadorias com nota de devolução, sendo que alguns produtos estão bons e não aceitaremos a devolução. Como a nota é grande e ja expirou o prazo de cancelamento, como fazemos para retornar com estas mercadorias para o cliente? De uma forma que o cliente fique com esse saldo disponível para devolução no nosso estoque? A empresa tem o costume de fazer nota de bonificação desses produtos que serão retonados para este cliente, mas esta nota não libera o saldo do cliente no nosso estoque, de forma que ele ficará sem ter como devolver com nota, pois não vamos conseguir realizar a entrada da mesma no nosso sistema por falta de saldo. 
Resumindo, como podemos fazer para devolver produto de uma nota de devolução? Podemos emitir algum tipo de nota, sem ser de bonificação?