NF-e de saída com data antes da NF-e de entrada

Em um e-commerce o cliente faz a compra do produto e o sistema gera instantâneamente a NF-e de saída, mas no estoque da loja não tem o produto, então no dia seguinte chega o produto na loja e é feito a entrada no estoque, ai sim a loja envia o produto ao cliente.
Dá algum problema isso, a loja vender sem ter estoque e fazer a entrada depois?

No meu entendimento pode gerar algum transtorno sim, pois a SEFA pode entender como fraude.
Meu conselho é: peça que seu cliente reconfigure o sistema dele e venda somente oque tem disponível em estoque, ou que ele gere a nota de saída de forma manual.