Fornecedor não aceita a recusa das notas

Boa tarde,

Um fornecedor emitiu as notas fiscais (venda e remessa) para uma filial nossa, diferente do  nosso pedido de compra, acontece que somos tomadores de crédito e nessa filial não podemos fazer uso do mesmo, o erro foi identificado dois dias após a entrega do material que já havia sido utilizado, o recebedor não se atentou na hora.

Então batemos a recusa mediante ao erro do CNPJ, e solicitamos a substituição das notas, porém o fornecedor afirma não poder acatar visto que deveria ter sido realizada a recusa no momento da entrega, e já termos utilizado o material. 

Não estou localizando respaldo na lei que trate especificamente de caso semelhante, poderiam me ajudar?

Daniele,
Nesse caso você não irá localizar um respaldo. Isto está mais voltado a um alinhamento entre as partes do que fiscal, visto que, a mesma já foi recebida e a mercadoria utilizada.
Creio que as duas empresas deva entrar em um acordo para resolver o problema.
Att.