Estoque: Crédi ICMS no desenquadramento do Simples

Ola pessoal, Preciso de uma grande ajuda. TEnho uma empresa que foi desenquadrada do simples Nacional em 12/2010 , tornando-se Lucro Presumido. A empresa possui um estoque , e como verifiquei no decreto DECRETO Nº 53.356, DE 26 DE AGOSTO DE 2008 ela se crédita do ICMS. Porém não sei ao certo como fazer esse crédito na entrada, e como ter o valor do crédito atráves do Estoque. POdem me ajudar?

Se a mercadoria de entrada estiver ligada a ativadade da empresa... por exemplo, voce compra para revender, este produto quando vem com icms destacado, vc se credita dele... porem na venda tem o debito!
especifique mais qual são esses produtos e a atividade da empresa...

A empresa é REVENDA DE AUTO PEÇAS , então a maioria dos produtos estão em substituição tributaria, sei que dessas mercadorias não me créditarei.
ENtão tenho que relacionar as NF das mercadorias que constam em estoque para que eu possa me creditar? Essa operação é feita atraves de uma emissão de NF de entrada?

desde ja agradeço.