retenção do iss em caraguatatuba

boa tarde pessoal,
a minha dúvida é a seguinte: Empresa da área da construção civil, sediada na cidade de Caraguatatuba, toma serviço de outros municípios vizinhos. Dentre esses prestadores de serviços, há os que são optantes do Simples Nacional e emitem as respectivas notas fiscais destacando o percentual ( anexos III, IV e V ) e o valor a ser recolhido, conforme determina o artigo 3º da LC 116/2003.
Mas o site da prefeitura não dá opção para se recolher conforme os percentuais e valores destacados em notas fiscais. É simplesmente de acordo com os códigos de serviços e percentuais préfixados.
Gostaria de saber se alguém está tendo o mesmo problema e como estaria resolvendo.
Muito obrigado

Oi Edson,

Verifique com calma o site da sua prefeitura. Pois, geralmente quando você escritura uma nota fiscal de tomador, tem uma opção, onde você informa se o prestador é ou não Optante pelo Simples Nacional. Só quando você informa esse campo, é que o sistema permite a mudança da alíquota.

Oi Lucas,
muito obrigado pela atenção. Mas, infelizmente não há campo para informar se o prestador é optante do Simples Nacional. Tivemos todo o cuidado possível nesse detalhe. Já pedi informação diretamente na prefeitura de Caraguatatuba, mas ninguém soube informar o procedimento correto.
grato