Tributação de Auto Escolas

Bom dia a todos.

Estou com dúvidas com relação a apuração de receitas e tributação de autoescolas.
Sabe-se que uma autoescola cobra de seus alunos um valor que engloba os serviços da escola e também as taxas do Detran.
Entendo que somente o valor dos honorários da escola são considerados como receita da empresa.

Minhas dúvidas são as seguintes:

1)- A Nota Fiscal emitida pela empresa deverá conter somente o valor efetivo da autoescola ou o total cobrado do aluno?

2)- Se eu considerar como receita somente o valor dos serviços, excluindo as taxas, provavelmente teria problemas com a malha da Receita Federal, principalmente por conta da DECRED, considerando que os valores recebido com cartão de crédito (que são maioria neste ramo de atividade) provavelmente seria maior que a receita declarada. Como poderia evitar isso?

Desde já, obrigado a todos

Boa tarde, nas auto escola que temos aqui as taxas e outros serviços os alunos que levam ao banco e pagam , já nas notas são feitas só com o valor do serviço da auto escola.