Tributação empresa de transporte subcontratada optante pelo

Boa tarde
estou com uma empresa de transporte optante pelo simples nacional.
ela trabalha como subcontrada ou seja quem emite os ct-e saos transportadoras, como sartco, fribon, 1500 transportes etc.
Gostaria de saber como faço a tributação?
qual documento fiscal devo emitir?

Boa tarde Alan
O certo é sua transportadora subcontratada emitir o CTe dela também, o valor do CTe seria o valor que pelo qual ela foi subcontratada, exemplo a fribon emite um CTe dela no valor de R$ 1.000,00 e subcontratou sua transportadora por R$ 900,00, neste caso você emite um CTe R$ 900,00, colocando os dados certinho do emitente e destinatário das mercadorias e colocar referente quais notas é o frete, e na observação do CTe você coloca que é frete subcontratado da transportadora Fribon e coloca o nº do CTe dela, e o simples você irá recolher sobre os R$ 900,00 (valor da subcontratação).

no caso quando faço um ct-e normal ele é referente a uma nf-e e coloco nele a chave de acesso da nota, nesse caso o que colocarei?

No caso de CT-e Subcontratada você irá emitir igual o CT-e normal, ou seja você terá que colocar também a chave de acesso da nota.

a empresa fez o frete mes 09, mas os clientes sempre trazem as notas e ct-e no mes 10, entao vou fazer o ct-e no mes 10, e o imposto eles vao pagar so mes 11?

para cada ct-e que a agenciadora de frete fizer eu vou ter que fazer um ct-e? nao consigo fazer varios de umas mesma empresa em um só?

No caso da subcontratação, de acordo com orientação de nossa consultoria, se a empresa subcontratada prestar o serviço no mês 09, então deverá emitir o CT-e também no mês 09, recolhendo o imposto do Simples Nacional no mês 10.
Quanto a emissão dos fretes, cada Estado tem sua legislação. No nosso caso, em Minas Gerais é permitido emitir CT-e global para cada contratante. Mas é conveniente você consultar a legislação de seu Estado antes.