Impostos Apurados na Tributação Incorreta

Bom Dia

Estou com uma empresa que em janeiro de 2014 era para ser excluída do Simples Nacional, o escritório contábil fez toda a apuração como lucro real desde o inicio do ano, mas somente em abril que foi feita essa exclusão gostaria de saber como proceder pois agora a empresa volto para o Simples Nacional e para gerar o imposto de março desse ano o sistema do Simples esta pedindo para min entregar a DEFIS e fazer a apuração do PGDAS que ficou em aberto de janeiro a março/14. Gostaria de saber como proceder pois se colocar os valores na apuração ira gerar guia do Simples e essa empresa já pagou todos os impostos dessas competências como Lucro Real.