Preencimento do "NIT" no PER/DCOMP para Restituiçã

Prezados,
Preciso esclarecer uma dúvida em relação ao preenchimento do campo do Número de Identificação do Trabalhador (NIT) no Programa PER/DCOMP.

A situação é que minha esposa é professora em duas faculdades, sendo que em uma delas o salário é maior que o teto previdenciário, cujo recolhimento do INSS já está no limite.
A outra faculdade se negou a deixar de recolher o INSS, então todo mês estou preenchendo o PER/DCOMP para restituição da contribuição previdenciária registrada no contra-cheque dessa segunda faculdade.
Estou fazendo isso desde alguns meses atrás, mas até hoje está em Análise.

O problema é que minha esposa tem 3 números de identificação de trabalhador. O primeiro é o NIT, que serve para recolhimentos individuais (o INSS diz que esse número é universal!). O segundo é o PIS utilizado por uma faculdade. E o terceiro é outro PIS utilizado pela outra faculdade. Estou usando o NIT no preenchimento da ficha no programa. Estou certo fazendo assim? Ou deveria preencher com o PIS que recolhe a maior contribuição previdenciária?

Obrigado!