frete fora da base de calculo

numa indústria de moveis no lucro presumido, onde a empresa cobra e destaca o frete na nota fiscal, a base de calculo para apurar pis, cofins, irpj, cssll icms ipi etc, podera ser apenas o valor dos produtos??? exceto todas as outras despesas assessorias, fretes, ipi etc???? afinal o que compõe base de calculo para apuração do impostos nesse caso ??? alguém poderia me ajudar nisso ??