Retificação de DI - Importação

Pessoal bom dia,

Estou com uma grande dúvida, meu cliente importou uma mercadoria e o fiscal solicitou a retificação da DI porque o NCM estava incorreto.
Com isso houve diferença de impostos como o II, PIS, COFINS e o ICMS, porém a nota fiscal foi emitida sem essas diferenças.

Isso está correto, esse valores que foram pagos a mais seria uma despesa para a empresa, sem possibilidade de se creditar desses impostos?

Atenciosamente,