IR E CSLL com base negativa

como devo proceder em caso da empresa apresentar prejuizos,no caso dela ter base negativa para imposto de renda e contribuicao social

Amigo,
Poderá ser compensado os valores inerentes ao pagamento da CSLL tendo a base de cálculo negativa, esta compensação está limitada ao máximo de 30% do lucro liquido ajustado pelas adições e exclusões, e não existe em Lei prazo de prescrição de tal.
Agora caso seu "lucro" contábil for negativo, não ha o que pagar.

e com o IR e a mesma coisa?

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Prezado Flávio.

Poderá compensar os valores pagos a maior durante exercícios encerrados através de perdcomp. Leia a IN 900 da Receita Federal. Te dará todos os passos para esse procedimento.