Subcontratação de Transporte, Lucro Presumido, Tributável pe

Nos casos de subcontratação de transporte, tratando-se de empresa do Lucro presumido a mesma será tributada sobre o liquido, como no caso das garagens de automóveis. Exemplo: Valor do conhecimento igual a R$100,00 o repasse feito ao motorista será de R$90,00. A subcontratadora ganhou R$10,00 no repasse, de que forma se procederá a tributação, bruto ou liquido?

Obs. O CT-e é emitido no valor total do conhecimento e emitido pela Subcontratadora(quem realiza o repasse dos CT-e);