ECF - Escrituração Contábil Fiscal quando dois estabelecimen

Olá, bom dia.
Alguém já teve experiência na situação que tem estabelecimento matriz e filial, mas estão em cadastros diferentes, como se fossem duas empresas distintas. O ECF deve ser enviado em um arquivo só, e é centralizado na matriz, então como poderíamos proceder?

Somente pela Matriz, mas englobando todo o movimento da filial(s), pois esta a escrituração tanto fiscal como contábil centralizada
Sds. Ribeiro