Exclusão do ICMS da BC de PIS e COFINS (Regime Não Cumulativo)

Boa tarde à todos!!

Faço a escrituração de uma empresa Lucro Real, industria, e que conseguiu a liminar para a exclusão do ICMS da base de cálculo de PIS e COFINS.

A minha dúvida é se na hora de creditar PIS e COFINS das entradas eu tenho que também excluir o ICMS da base de cálculo. No início eu imaginei que a exclusão do ICMS seria somente para as saídas. Agora fiquei em dúvida.

Alterei o meu sistema e ele está excluindo o ICMS até do frete que lancei como crédito.

Alguém mais tem um caso como esse?

Obrigada!