Contabilização de Utilização de Software

Bom dia

Minha dúvida é a seguinte, tenho um empresa que vai gerir, um sistema adquirido por outra!
A que está administrando o sistema é quem recebendo os valores das mensalidades e emitindo as nfs de utilização do sistema para as empresas que aderiram ao sistema, enfim todo o processo!
O pagamento para a PROPRIETÁRIA do sistema se daria por Royalties, só faria um contrato de pagamento de um percentual como Royalties para ela, de que forma ficaria o mais correto, e outro detalhe, por a empresa que está gerindo o sistema ter já feito a emissão para as empresas que utilizam, ela precisaria emitir nf do valor repassado para a proprietária do sistema ou somente com um contrato já justificaria o valor pago?