Subcontratação Transporte de Carga Lucro presumido

Uma empresa do lucro presumido que foi subcontratada o icms é pago pelo contratante ate ai ok, porem os outros impostos como pis, cofins cssl e ir quem paga é a subcontratada ? muda a aliquota ? Outra coisa se sim, ela paga somente pelo liquido ne por exemplo

c Exemplo: Valor do conhecimento igual a R$100,00 o repasse feito ao motorista será de R$90,00. A subcontratadora ganhou R$10,00 no repasse, de que forma se procederá a tributação, bruto ou liquido?